8 günde 2 kupa kazanan Bjelica dalga konusu oldu

Trabzonspor'un başına geçeceği konuşulan Nenad Bjelica, teknik direktörlük  kariyerine 15 Eylül 2007'de Avusturya Ligi takımlarından FC Kärnten'de başladı. Oyuncu ve geçici teknik direktör olarak görev yaptı. Avusturya ekibi 1 Temmuz 2008'de resmi sözleşme imzaladı. Futbolculuk kariyerinin bitmesinden hemen bir gün sonra.

Bjelica, Mart-Aralık 2009 tarihleri ​​arasında bir başka Avusturya takımı Lustenau 07'nin teknik direktörüydü. Mayıs 2010'dan Haziran 2013'e kadar da yine Avusturya’da WAC St.Andrä’yı çalıştırdı. 

17 Haziran 2013’te Bjelica, Avusturya Wien’in başına geçti. Takım 2013-14 sezonunda UEFA Şampiyonlar Ligi grup aşamasına katılmaya hak kazandı. Hırvatistan şampiyonu Dinamo Zagreb'e elendi. 16 Şubat 2014’te istifa etti. 
Haziran 2014'te İtalya Serie B takımlarından Spezia’nın başına geçti. Ağustos 2016'da Polonya’dan Lech Poznań'ın yeni teknik direktörü oldu. 10 Mayıs 2018'de Lech'teki sözleşmesi feshedildi.

15 Mayıs 2018'de Bjelica, Hırvat şampiyonu Dinamo Zagreb ile iki yıllık  anlaşma imzaladı. Dört gün sonra Hırvatistan Birinci Ligi'ni kazandıkları için yapılan kutlamalara katıldı. Şampiyon takımın teknik direktörü olarak anons edildi. Hırvatistan’da kendisiyle alay edilmesine neden oldu. 

23 Mayıs 2018'de Hırvat Kupası'nı kazandı. 8 günde hem şampiyonluk hem de kupa zaferi yaşayarak futbol tarihe geçti. Ertesi yıl bir şampiyonluk daha yaşadı. 16 Nisan 2020'de ise tüm yardımcıları görevden alınınca Bjelica da Dinamo Zagreb ile sözleşmenin sona erdiğini açıkladı. 

5 Eylül 2020'de Osijek teknik direktörü oldu. 87 maçta 1.95 puan ortalaması yakaladı. 29 Ağustos'ta sözleşmesi yenilenmedi. Takım bulamadı. Yaklaşık 1 sezondur kulüp arıyor.